Vào 25 năm trước, rất nhiều sinh vật khổng lồ xuất hiện trên khắp thế giới, phá hủy và nghiền nát mọi thứ trên đường đi của chúng. Chúng được biết đến là Dragon. Chúng đột nhiên xuất hiện và cũng đột nhiên biến mất. Không lâu sau, trong nhân loại đã có những thiếu nữ mang sức mạnh của loài rồng được sinh ra, được gọi là D. Khi tiếp xúc với 1 con Rồng tương thích, D sẽ bị biến thành rồng Mononobe Yuu là D nam duy nhất. Được cử đến học viện Midgar theo lệnh của NIFL với nhiệm vụ mật là tiêu diệt tất cả D có nguy cơ biến thành rồng. Liệu anh có thể hoàn thành nhiệm vụ của mình?